Secondary disinfection provides an essential residual that prevents the regrowth of microorganisms in the distribution network. Chlorine, chloramines, and chlorine dioxide are commonly used as secondary disinfectants. However, chloramine is the most commonly used secondary disinfectant. Chloramine is not virucidal and is only slightly effective in killing Giardia cysts.

When water passes through various stages of purification, it must be disinfected to the extent necessary, depending on its intended use. For example, drinking water, after purification and removal of suspended and dissolved substances, must be free from any microbial contamination and not pose any health and safety risk to the consumer. The destruction or inactivation of microscopic organisms and pathogenic microorganisms is known as water disinfection.

آلاینده های موجود در آب های آشامیدنی قبل از ورود به شبکه آبرسانی حاوی مقادیر بالایی از مواد معدنی و فلزات و همچنین میکروارگانیسم های بیماری زا می باشند که به شیوه های مختلف اغلب آنها از بین میروند. انجام راهکارهای مختلف تصفیه تاثیر زیادی بر باکتری های بیماری زا موجود در آب ها نداشته و به همین دلیل در مرحله تصفیه شیمیایی از روش ها و تجهیزات و مواد مختلفی استفاده میشود تا این باکتری ها از بین بروند.